Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms