Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNMT1P26358 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms