Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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LMO1P25800 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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LMO1P25800 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LMO1P25800 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LMO1P25800 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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