Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRGP23470 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms