Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD247P20963 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms