Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LBPP18428 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LBPP18428 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LBPP18428 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LBPP18428 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LBPP18428 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LBPP18428 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LBPP18428 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms