Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms