Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms