Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DMDP11532 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DMDP11532 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DMDP11532 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DMDP11532 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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