Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOP2AP11388 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms