Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms