Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C8orf89P0DMQ9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf89P0DMQ9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms