Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNB1P01574 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms