Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFP01375 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFP01375 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNFP01375 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms