Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIN3BO75182 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms