Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSVO60911 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSVO60911 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSVO60911 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms