Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEP290O15078 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CEP290O15078 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEP290O15078 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEP290O15078 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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