Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2K7ER74 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms