Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HHLA1C9JL84 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms