Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IQCJ-SCHIP1C9J366 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms