Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SOBPA7XYQ1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms