Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms