Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VWA8A3KMH1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms