Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA6A0AVT1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA6A0AVT1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms