Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K4Q9Y6R4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms