Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TNPO3Q9Y5L0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms