Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CCL27Q9Y4X3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCL27Q9Y4X3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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