Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms