Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRF3Q9ULT6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRF3Q9ULT6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms