Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPNE7Q9UBL6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms