Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms