Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHPF2Q9P2E5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms