Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms