Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms