Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOPCQ9HD26 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms