Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms