Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms