Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTNAP3Q9BZ76 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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