Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHMP4AQ9BY43 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms