Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms