Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SSBP4Q9BWG4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms