Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NAP1L3Q99457 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms