Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YTHDC1Q96MU7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YTHDC1Q96MU7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms