Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms