Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-CQ95604 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms