Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERCC4Q92889 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERCC4Q92889 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERCC4Q92889 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERCC4Q92889 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERCC4Q92889 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERCC4Q92889 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms