Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms