Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF148Q8N7C7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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RNF148Q8N7C7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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