Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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