Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms